Bioclipse é um aplicativo para download que será executado no computador local, mas também dá a possibilidade do usuário se comunicar com servidores para a recuperação de dados e serviços computacionais. O Bioclipse possui ferramentas avançadas para interagir com recursos da Web semântica. Ele permite a integração e recuperação de dados em RDF, OWL e formatos semelhantes, com visualizações gráficas. O aplicativo pode ser usado em diversas áreas tais como: Bioinformática, Farmacologia e Química.
